４月１６日（日）、長崎県は県内で新たに２９人が新型コロナウイルスに感染したと発表した。新規感染者全員が医療機関で診断された。総数は先週日曜９日の４３人から１４人減り、２日連続で前週同曜日を下回った。前日１５日（土）の４９人からは２０人減った。年齢別では１～４歳が２人、５～９歳４人、１０代１人、２０代６人、３０代１人、４０代１人、５０代５人、６０～６４歳１人、６５～６９歳１人、７０代４人、８０代２人、９０歳以上１人。６５歳以上や入院が必要な人、妊婦などハイリスク者の発生届は１０人。居住地別では長崎市が最多４人、佐世保市・島原市・大村市・対馬市・五島市・雲仙市各１人。１５日現在の県内の入院患者は前日より１人増え２０人。重症者は変わらず０人。病床使用率は２．９％（前日比＋０．１）。宿泊療養者は６人（前日比±０）。施設療養者は３５人（前日比＋１）。死者の発表はなく、県内感染者の累計は３３万７３５１人となった。